生物凈化車間按照生產和科研可以分為生物凈化車間和生物學安全凈化車間兩種。生物凈化車間增加了殺菌處理環節，目的是控制生物顆粒對衛生環境和工作人員造成的污染。生物凈化車間設計除了工業凈化車間設計的幾大參數外，還要采取負壓措施，避免生產的產品對環境的影響。生物學安全凈化車間主要的工作人員是科研人員，用于產品研發和科學試驗。生物凈化車間設計中要考慮生物因素的影響，設計中要注意以下參數。

(1)控制生物濃度。凈化車間除了要滿足非生物濃度的要求，還要對生物濃度進行控制，采取措施控制細菌浮菌量和沉降量。

(2)負壓與隔離措施。生物安全凈化車間必須保證生產車間處于負壓狀態，維持室內負壓，因為生物顆粒的危害程度較高。此外，設計中還應采取隔離措施，用安全柜或者隔離箱，隔離生物顆粒與操作人員，這時的隔離為二次隔離，為生物顆粒污染增添了一道安全屏障。通過隔離措施將潔凈室變為負壓區，有效地防止了危險生物顆粒的污染。

(3)換氣次數要求。生物潔凈室設計的排風危害性大，必須控制排風的出風風速在每秒十三米以上。過濾器要以鋁箔為板，以金屬做框，且要及時檢查，及時更換，目的是為了防止潮濕滋生細菌和腐蝕。

(4)其他要求。生物凈化車間設計時通風管道采用不銹鋼材料，保證焊接的順滑度，嚴格對生產人員的衣物進行消毒處理，進出生產車間更換衣物，進行淋浴及干燥處理，防止由生產人員將生物病菌帶入生產車間

綜上所述，醫藥凈化車間是保證藥品生產和質量管理的基礎設施，醫藥凈化車間的必須以控制生物顆粒和非生物顆粒為設計、施工和運行的目標。因此，在醫藥廠房潔凈室設計中要嚴格遵循藥品生產質量管理規范和潔凈廠房設計規范，選擇合理的、滿足藥品生產要求的空氣潔凈度級別、換氣次數、氣流組織形式等設計參數，嚴格按照要求對醫藥凈化車間進行設計、施工、測評，嚴格對潔凈室的工作人員進行消毒處理。