潔凈技術是實現藥品生產質量管理的基礎措施，藥品、食品等均是特殊的產品，關系到人們的人身安全，其生產、儲存、檢測等各個環節必須保證潔凈度，潔凈技術在醫藥行業的廠房潔凈室設計中應用就是應了國家相關標準和藥品生產管理規范的要求。目前，醫藥廠房潔凈室設計中存在一些問題，必須引起我們的重視，杜絕這類問題，才能真正實現潔凈度的要求。一是由于工程成本的制約，一些中、小潔凈工程設計和施工單位不按國家標準施工，造成設計的潔凈室不符合潔凈廠房設計規范，無法滿足企業生產的需要。二是將潔凈室性能檢測和測評工作混為一談，有些企業認為完成竣工檢測就可以投入生產，而忽視了潔凈室的綜合測評工作，這兩者實施主體不同、檢測內容不同，不可省略任何一個環節。三是潔凈室本身的問題，潔凈室打掃不徹底、不規范、潔凈室通風設備不合理、潔凈室布局不科學等。
